Pan profesor Zbigniew Madeja jest biologiem komórkowym specjalizującym się w badaniach nad aktywnością ruchową komórek prawidłowych i nowotworowych. Jest autorem lub współautorem ponad 160 publikacji naukowych oraz kilku patentów krajowych i europejskich. Brał udział w realizacji licznych krajowych i międzynarodowych projektów badawczych. Prof. Madeja jest związany z Uniwersytetem Jagiellońskim od początku swojej kariery naukowej – ukończył tu studia na kierunku Biologia (1985), uzyskał stopień doktora (1991) oraz doktora habilitowanego (2003), a także tytuł profesora nauk biologicznych (2010). Doświadczenie zawodowe zdobywał także podczas staży naukowych w Karolinska Institutet w Szwecji i na Uniwersytecie Berneńskim w Szwajcarii. Na Wydziale Biochemii, Biofizyki i Biotechnologii pełnił funkcje kierownika Zakładu Biologii Komórki (od 2006), prodziekana ds. nauki i współpracy międzynarodowej (2012–2014) oraz dziekana wydziału (2014–2020). W czasie sprawowania przez niego funkcji prodziekana i dziekana, Wydział BBiB UJ dwukrotnie uzyskał najwyższą kategorię A+ oraz status Krajowego Naukowego Ośrodka Wiodącego (KNOW) w ramach Jagiellońskiego Konsorcjum Naukowo-Biznesowego dla Badań Biomolekularnych i Komórkowych.

Profesor Madeja zasiadał także w Senacie UJ oraz licznych komisjach senackich, był członkiem Rady Nadzorczej Jagiellońskiego Centrum Innowacji, Rady Nadzorującej Centrum Rozwoju Systemów Zintegrowanych UJ, Rady Centrum Promieniowania Synchrotronowego, Rady Kampusu 600-lecia Odnowienia UJ, Rady Małopolskiego Centrum Biotechnologii oraz Rady Nadzorczej Jagiellońskiego Centrum Rozwoju Leków (JCET). W latach 2021–2024 sprawował również funkcję członka Rady Uczelni Uniwersytetu Jagiellońskiego.

Profesor Madeja jest członkiem licznych towarzystw naukowych i komitetów, m.in. Polskiego Towarzystwa Biologii Komórki (w latach 2003–2008 pełnił funkcję wiceprzewodniczącego oddziału krakowskiego), Komitetu Cytobiologii przy II Wydziale PAN (od 2003 roku, a w latach 2011–2014 był członkiem Prezydium Komitetu), Rady Naukowej Instytutu Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego PAN w Warszawie (2007–2010 i 2023–2026) oraz Komitetu Biologii Molekularnej Komórki PAN (od 2016 roku).